OS や ソフトウェアのインストール代行から、深層学習・Docker などの環境も構築
アプライドでは HPC 製品(ハイ・パフォーマンス・コンピューティング)の製造だけでなく、科学技術計算用ソフトウェアのインストール代行も承っております。弊社製の HPC 製品であれば、納品後にすぐにお使いいただけるように、工場で製造後に専門スタッフがソフトウェアのインストールを行ってから出荷いたします。また、弊社 HPC 製品だけではなく、他社製の HPC 製品へのインストール代行も承っております。OS から 科学技術計算用ソフトウェア、ディープラーニング設定、Docker 環境構築など、お気軽にお問い合わせください。
Gaussian 16W
Gaussian 16 は、幅広い分野で利用されている電子状態計算や計算化学モデルの電子構造プログラムです。マルチプロセッサー環境における共有メモリ並列はもちろん、クラスタ環境での並列(Linda ライセンスが必要)、その両方を使った並列処理にも対応しています。
分子や結晶の電子状態を計算して、励起状態やバンドギャップの計算や最安定構造の計算等が可能です。また、GaussViewを使うと対象の構造や HOMO-LUMO の状態を可視化できます。作成したインプットファイルを読み込むこともできるますが、構造データがあれば GaussView で読み込んでから計算を走らせることも可能です。その他、燃焼など化学反応、また IR や NMR のスペクトル計算にも利用できます。
動作推奨モデル
インテル® Core™ i9-12900K
64GB(32GB x2)DDR4-3200
1TB SATA-SSD(OS)
1TB M.2 NVMe-SSD(スクラッチ)
ハードウェア選定のポイント
CPU:有機物の構造ではコア数重視、他はクロック重視になります。
GPU:NVIDIA® T400 から T1000 程度の安価な GPU で十分です。
メモリ:計算するものや計算方法に依存しますが、おおむね 64GB以上 あれば問題ない。
ストレージ:タンパク質や重い元素を扱う場合には、スクラッチ・ディスクが必須です。
インストール代行費用: 22,000 円
GROMACS
フローニンゲン大学で開発された分子動力学シミュレーション用のソフトウェアです。利用者の多いソフトウェアパッケージの一つで、CPU および GPU 上で動作します。GNU GPL ライセンスに基づいて自由に改変可能であることも特徴です。
分子動力学計算、固体・液体の熱物性(比熱・拡散係数等)の計算が可能です。また、配位子(リガント)とタンパク質の結合自由エネルギーや水溶液中のタンパク質の動的挙動を計算できます。水系の溶液で用いられることが多く、有機溶媒系では Amber を用いることが多いです。タンパク質結晶やポリマーなど有機物の計算にも用いられます。
動作推奨モデル
インテル® Core™ i9 10980XE
128GB(32GB x4)DDR4-2933
1TB SATA3-SSD
[4基] NVIDIA® GeForce® RTX® 3080 10GB-GDDR6
ハードウェア選定のポイント
CPU:クロック数重視だが実コア数も必要、MPI で使用するコア数を指定する必要があります。
GPU:RTX3080 以上が望ましく、複数枚で効果が高いdす。
メモリ:64GB 程度あれば十分だが、計算するものによっては 128GB 以上必要な場合があります。
インストール代行費用:137,500 円
LAMMPS
サンディア国立研究所の分子動力学プログラムです。並列計算に MPI を利用し、GNU GPL ライセンスに基づいて配布されるオープンソースのソフトウェアです。
汎用性が高く有機物・無機物問わずに様々な物質に応用可能で、対象の熱物性(比熱・拡散係数・熱伝導度)や密度、粘度などを取得できます。プログラム自身の拡張性の高さと、入力スクリプトによる柔軟な制御が特徴的で、他の分子動力学ソフトの GROMACS や AMBER のソルバを使うことが可能です。
動作推奨モデル
インテル® Xeon® Silver 4314
64GB(8GB x8)DDR4-3200 Registered-ECC
1TB SATA3-SSD
[2基] NVIDIA® GeForce® RTX® 3080 10GB-GDDR6
ハードウェア選定のポイント
CPU:クロック数・実コア数をともに重視するが、実コア数が多いほうが計算速度は向上します。
MPI で使用するコア数を指定する必要があります。
GPU:NVIDIA® GeForce RTX™ 3080 以上の GPU の複数枚利用に対応しています。
メモリ:64GB 以上必要です。
インストール代行費用:137,500 円
MATLAB
ベクトルや行列式の演算を得意とする計算ソフトで、C, C++, C#, JAVA, Fortran, Pythonを含む他のプログラム言語とのインターフェース機能を有しているため、これらの言語をMatLab上で扱うことができます。
データの解析からモデル式を構築できるので、理論式が分からない状態でも拡散、熱伝導など物理的な解析から、化学工学など反応を含むマクロな変化の解析ができます。
そのため、多数のデータから法則を見つけ、未来の現象に利用する深層学習に用いることができます。
行列式が扱えるため、有限差分法や有限要素法などを用いて複雑な偏微分方程式を解くことも可能であるばかりか、ある種のプログラム言語の要素もあるため、データを引用して数式を立て、それを解いた後で、結果の分散評価を行うなどの統計計算を一つのスキームとして行わせることも可能です。
ハードウェア選定のポイント
CPU:計算内容にもよりますが、コア数が多い方が有利な場合が多いです。
GPU:GPUを用いた計算も可能です、Compute Capability 3.5-9.Xまで対応しております。最新のGPUは対応しております。
メモリ:計算にもよりますが、CPUでの計算ではメモリの量が必要になることがあります。GPUの計算では一般的にメモリは少なくて済みますが、可能な範囲で多めに搭載することをお勧めします。
インストール代行費用:44,000 円
OpenFOAM
OpenFOAM は、主に OpenCFD Ltd によって開発された無料のオープン ソース CFD ソフトウェアです。化学反応、乱流、熱伝達を含む複雑な流体の流れから、音響、固体力学、電磁気学まで、あらゆる問題を解決する幅広い機能があります。
例えば、流体の解析が可能で、特に水や空気など液体・気体の数値流体解析に用いられます。その他、燃焼解析、応力計算や電磁流体解析も専用のソルバで計算可能です。専用の可視化ソフトや前後処理用のソフトが多数あるので容易に計算でき、修正もソフト本体ではなく、ソルバの修正を行うことで対応できるため特殊な流体解析にも対応可能です。
動作推奨モデル
インテル® Xeon® Silver 6326
256GB(64GB x4)DDR4-3200 Registered-ECC
1TB SATA3-SSD
NVIDIA® T1000 8GB-GDDR6
ハードウェア選定のポイント
CPU:コア数と二次キャッシュが重要で、Xeon Scalable Gold 以上が必須です。
メモリ:解析するメッシュ数に依存し、256GB 以上が必要です。
インストール代行費用: 110,000 円
Quantum Espresso
平面波基底+擬ポテンシャル法(ノルム保存およびウルトラソフト)を用いた密度汎関数理論(DFT)に基づいた第一原理電子状態計算パッケージです。GNU GPL ライセンスに基づいてフリーソフトウェアとして無料で配布されています。
結晶や結晶表面の電子状態の計算が可能で、バンド構造や状態密度、安定状態が高精度に計算できます。表面に吸着した元素の電子状態や反応解析の計算、フォノン周波数などの応答特性、構造最適化の計算も可能です。基本プログラムのほかに多数のコアパッケージ・プラグインが含まれ、MPI による並列計算にも対応してます。
動作推奨モデル
インテル® Xeon® W-2255
64GB(16GB x4)DDR4-3200 Registered-ECC
1TB M.2 NVMe-SSD
NVIDIA® GeForce® RTX® 3080 10GB-GDDR6
ハードウェア選定のポイント
CPU:クロック数重視で、次にコア数が重要になります。
GPU:RTX3080 以上が望ましく、複数枚で効果が高いです。
メモリ:64GB 程度あれば十分だが、重い元素のバンドギャップを扱う場合は 256GB 以上必要な場合があります。
インストール代行費用: 44,000 円 〜 137,500 円
ソフトウェア・インストール代行および環境構築 費用一覧
インストール作業名称 | OS | 技術料(税込) | ||||||
Ubuntu 22.04 | Ubuntu 20.04 | CentOS7 | RHEL8 | RHEL9 | Windows 10 | Windows 11 | ||
Linux ディープラーニング構築 (NV HPC、NVIDIA Docker、venv環境構築) |
◯ | ◯ | △ | 137,500円 | ||||
Linux ディープラーニング構築 (NV HPC、NVIDIA Docker) |
◯ | ◯ | ◯ | ◯ | ◯ | 137,500円 | ||
Windows ディープラーニング構築(Anaconda-GPU設定あり) | ◯ | 137,500円 | ||||||
FPGA インストール代行 | ◯ | 137,500円 | ||||||
COGNEX インストール代行 | ◯ | 22,000円 | ||||||
Torque インストール代行 | ◯ | ◯ | 44,000円 | |||||
OpenForm インストール代行 | ◯ | 110,000円 | ||||||
インテル コンパイラ(OneAPI 設定) | ◯ | ◯ | ◯ | ◯ | ◯ | 66,000円 | ||
DualBoot インストール代行 | ◯ | ◯ | ◯ | ◯ | ◯ | 22,000円 | ||
BricsCAD インストール代行 | ◯ | 13,200円 | ||||||
WindowsリカバリーUSB作成 | ◯ | ◯ | 13,200円 | |||||
UPS設定(EatonとOmron製) | ◯ | ◯ | ◯ | 22,000円 | ||||
UPS設定(ネットワーク)(EatonとOmron製) | ◯ | ◯ | 33,000円 | |||||
Anaconda設定(Anacondaのみ) | ◯ | ◯ | 13,200円 | |||||
R | ◯ | ◯ | ◯ | 4,400円 | ||||
R インストール代行 | ◯ | 44,000円 | ||||||
Gromacs (GPU動作) インストール代行 | ◯ | ◯ | 137,500円 | |||||
Lammps (GPU動作) インストール代行 | ◯ | ◯ | 137,500円 | |||||
Quantum ESPRESSO(CPU) ンストール代行 CPUのみの使用GCCコンパイル |
◯ | ◯ | ◯ | ◯ | 44,000円 | |||
Quantum ESPRESSO(CPU)nvhpc使用 インストール代行 |
◯ | 44,000円 | ||||||
Quantum ESPRESSO(GPU)nvhpc使用 インストール代行 |
◯ | 137,500円 | ||||||
Amber インストール代行 | ◯ | 137,500円 | ||||||
NV HPC インストール代行 | ◯ | ◯ | ◯ | ◯ | 44,000円 | |||
Relion インストール代行 | ◯ | ◯ | 22,000円 | |||||
Samba インストール代行 | ◯ | ◯ | ◯ | 22,000円 | ||||
ROS インストール代行 | ◯ | 44,000円 | ||||||
TigerVNC インストール代行 | ◯ | ◯ | 44,000円 | |||||
Webmin インストール代行 | ◯ | 22,000円 | ||||||
IMOD インストール代行 | ◯ | 22,000円 | ||||||
GnuPlo インストール代行 | ◯ | 22,000円 | ||||||
Gaussian 16W インストール代行 |
◯ | ◯ | 22,000円 | Clamav インストール代行 (Ubuntu用ウイルス対策ソフト) |
◯ | ◯ | 13,200円 | |
Visual Studio 2022 インストール代行 |
◯ | ◯ | 13,200円 | |||||
SQLサーバーインストール+ユーザー作成 |
◯ | ◯ | 33,000円 | |||||
SQLサーバーインストール+ユーザー作成+ポート開放 |
◯ | ◯ | 44,000円 | |||||
SQLサーバーインストール+ユーザー作成+ポート開放+SAユーザー認証 |
◯ | ◯ | 66,000円 | |||||
AMD Optimizing CPU Libraries (AMDのCPUのみ) |
◯ | ◯ | ◯ | ◯ | ◯ | 22,000円 | ||
OpenMP インストール代行 | ◯ | ◯ | ◯ | ◯ | ◯ | 22,000円 | ||
MATLABインストール※ | ◯ | ◯ | 22,000円 |
※ソフトウェアは別途購入必要
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